Usa-Places.com ने सैन फ्रांसिस्को में लगभग 5 प्राथमिक विद्यालय को सूचीबद्ध किया है। . सैन फ्रांसिस्को के कुछ टॉप रेटेड प्राथमिक विद्यालय हैं। मिशन प्रिपरेटरी स्कूल, लियोनार्ड आर फ्लिन प्राथमिक विद्यालय, सेंट पीटर्स पैरिश स्कूल, कैथरीन माइकल्स स्कूल & जॉर्ज मोस्कोन प्राथमिक विद्यालय.