Usa-Places.com ने स्टॉकटन में लगभग 8 गैर लाभकारी संगठन को सूचीबद्ध किया है। . स्टॉकटन के कुछ टॉप रेटेड गैर लाभकारी संगठन हैं। सैन जोकिन काउंटी मानव सेवा एजेंसी, महिला केंद्र-युवा एवं परिवार सेवाएं, सैन जोकिन काउंटी के बाल दुर्व्यवहार निवारण परिषद, NAACP स्टॉकटन शाखा, बहाल, बाल शोषण निवारण परिषद, सैन जोकिन काउंटी परिवार न्याय केंद्र & सैन जोकिन कम्युनिटी डेटा को-ओप.