Usa-Places.com ने सैन डिएगो में लगभग 6 प्राथमिक विद्यालय को सूचीबद्ध किया है। सैन डिएगो के कुछ टॉप रेटेड प्राथमिक विद्यालय हैं। हावर्ड पेंस प्राथमिक विद्यालय, फिन्नी मर्टल एस प्राथमिक स्कूल, बेरी प्राथमिक विद्यालय, मेंडोज़ा प्राथमिक विद्यालय, एमोरी प्राथमिक विद्यालय & जुआरेज लिंकन प्राथमिक विद्यालय।