Usa-Places.com ने सैन फ्रांसिस्को में लगभग 27 गैर लाभकारी संगठन को सूचीबद्ध किया है। सैन फ्रांसिस्को के कुछ टॉप रेटेड गैर लाभकारी संगठन हैं। पुस्तक के लिए सैन फ्रांसिस्को केंद्र (एसएफसीबी), दृष्टिबाधित और नेत्रहीनों के लिए लाइटहाउस, सेंट्रो लातीनी डी सैन फ्रांसिस्को, ला कासा डे लास मद्रेसो, कला के कैलिफोर्निया कॉलेज (सीसीए) वाटिस संस्थान, किवा, अमरीकी रेडक्रॉस, हैमिल्टन परिवार | प्रशासनिक कार्यालय, सैन फ्रांसिस्को एड्स फाउंडेशन & सैन फ्रांसिस्को पार्क एलायंस।