Usa-Places.com ने सैन फ्रांसिस्को में लगभग 21 गैर लाभकारी संगठन को सूचीबद्ध किया है। सैन फ्रांसिस्को के कुछ टॉप रेटेड गैर लाभकारी संगठन हैं। रूबी का क्ले स्टूडियो और गैलरी, चीयर फॉर लाइफ फाउंडेशन, चीयर सैन फ़्रांसिस्को, सैन फ्रांसिस्को की इंपीरियल काउंसिल इंक।, सैन फ्रांसिस्को की स्वीडिश सोसायटी, लेट्स किक एएसएस-एड्स सर्वाइवर सिंड्रोम, सिटी प्लानिंग के सैन फ्रांसिस्को मित्र, कौतुक ओपेरा प्रोडक्शंस, गैल्वेस्टन काउंटी का परिवार सेवा केंद्र & ग्रास रूट्स गे राइट्स फाउंडेशन।