Usa-Places.com ने Missoula में लगभग 3 निजी स्कूल को सूचीबद्ध किया है। Missoula के कुछ टॉप रेटेड निजी स्कूल हैं। सेंट जोसेफ प्राथमिक और ग्रेड स्कूल, मिसौला कैथोलिक स्कूल एथलेटिक कॉम्प्लेक्स & एप्पल ब्लॉसम मोंटेसरी स्कूल।