Usa-Places.com ने सैन राफेलो में लगभग 5 निजी स्कूल को सूचीबद्ध किया है। सैन राफेलो के कुछ टॉप रेटेड निजी स्कूल हैं। ब्रैंडिस मारिन, फ्यूजन अकादमी मारिन, मारिन वाल्डोर्फ स्कूल, मार्क डे स्कूल & कौलब्रिज स्कूल।