Usa-Places.com ने जेफरसन सिटी में लगभग 14 स्कूलों को सूचीबद्ध किया है। जेफरसन सिटी के कुछ टॉप रेटेड स्कूलों हैं। सेंट मार्टिन कैथोलिक पैरिश स्कूल, जेसीपीएस शिक्षा केंद्र, दक्षिण पश्चिम स्कूल, 1105 लाफायेट ड्राइव, लिंकन विश्वविद्यालय, दक्षिण पश्चिम स्कूल, प्रारंभिक खोजकर्ता पूर्वस्कूली, लेगेट और प्लैट एथलेटिक सेंटर, बाइंडर पार्क स्टेनर हाउस & बचपन का हस्तक्षेप।